isi senarai ini hanya memuat destinasi-destinasi yang dilayani oleh Syarikat Penerbangan Batik Air Sahaja (ID) , Sehingga September 2019, Batik Air mengendalikan keseluruhan 47 laluan domestik dan 15 laluan antarabangsa, dengan frekuensi lebih dari 350 penerbangan setiap hari. Destinasi antarabangsa, termasuk Singapura, Bangkok, Chennai, dan Perth, serta Guilin, Nanning, Kunming dan Shenzhen di China. [7]

Asia

Asia Barat

Arab Saudi

• Jeddah JED - Lapangan Terbang Antarabangsa King Abdulaziz
• Madinah al-Munawwarah MED - Lapangan Terbang Antarabangsa Putera Mohammad Bin Abdulaziz

Asia Selatan

India

• Chennai MAA - Lapangan Terbang Antarabangsa Chennai [8]

Asia Tenggara

Indonesia

• Ambon AMQ - Lapangan Terbang Pattimura
• Balikpapan BPN - Lapangan Terbang Sultan Aji Muhamad Sulaiman
• Banda Aceh BTJ - Lapangan Terbang Sultan Iskandar Muda
• Bandar Lampung TKG - Lapangan Terbang Radin Inten II
• Bandung BDO - Lapangan Terbang Husein Sastranegara
• Banjarmasin BDJ - Lapangan Terbang Syamsudin Noor
• Kota Batam BTH - Lapangan Terbang Antarabangsa Hang Nadim
• Banyuwangi BWX - Lapangan terbang Banyuwangi
• Bengkulu BKS - Lapangan Terbang Fatmawati Soekarno
• Kabupaten Berau BEJ - Lapangan Terbang Berau
• Denpasar DPS - Lapangan Terbang Antarabangsa Ngurah Rai - Bandar Tumpuan Batik Air [9]
• Gorontalo GTO - Lapangan Terbang Jalaluddin
• Jakarta CGK - Lapangan Terbang Antarabangsa Soekarno-Hatta - Hab utama Batik Air [10][11][12]
• Jakarta HLP - Lapangan Terbang Antarabangsa Halim Perdanakusuma - Hab utama Batik Air
• Kota Jambi DJB - Lapangan Terbang Sultan Thaha
• Kota Jayapura DJJ - Lapangan Terbang Sentani
• Kota Kendari KDI - Lapangan Terbang Haluoleo
• Kota Kupang KOE - Lapangan Terbang El Tari
• Labuan Bajo LBJ - Lapangan Terbang Komodo
• Lubuklinggau LLJ - Lapangan Terbang Silampari
• Luwuk, Banggai LUW - Lapangan Terbang Bubung [13]
• Makassar UPG - Lapangan Terbang Antarabangsa Sultan Hasanuddin
• Malang MLG - Lapangan Terbang Abdul Rachman Saleh
• Manado MDC - Lapangan Terbang Antarabangsa Sam Ratulangi
• Kota Mataram LOP - Lapangan Terbang Antarabangsa Zainuddin Abdul Madjid
• Kabupaten Manokwari MKW - Lapangan Terbang Rendani
• Medan KNO - Lapangan Terbang Antarabangsa Kuala Namu
• Merauke, Merauke MKQ - Lapangan Terbang Mopah
• Padang PDG - Lapangan Terbang Antarabangsa Minangkabau
• Palangkaraya PKY - Lapangan Terbang Tjilik Riwut
• Palembang PLM - Lapangan Terbang Antarabangsa Sultan Mahmud Badaruddin II
• Kota Palu PLW - Lapangan Terbang Mutiara SIS Al-Jufrie
• Pangkal Pinang PGK - Lapangan Terbang Depati Amir
• Pekanbaru PKU - Lapangan Terbang Sultan Syarif Kasim II
• Pontianak PNK - Lapangan Terbang Supadio (Ditamatkan)
• Samarinda AAP - Lapangan Terbang Antarabangsa APT Pranoto [14]
• Semarang SRG - Lapangan Terbang Antarabangsa Achmad Yani
• Siborong-Borong, Tapanuli Utara DTB - Lapangan terbang Silangit
• Kota Sorong SOQ - Lapangan Terbang Sorong
• Surakarta SOC - Lapangan Terbang Antarabangsa Adisumarmo
• Kota Surabaya SUB - Lapangan Terbang Antarabangsa Juanda - Bandar Tumpuan Batik Air
• Tanjung Pandan, Belitung TJQ - Lapangan Terbang Buluh Tumbang
• Tarakan TRK - Lapangan Terbang Juwata
• Ternate TTE - Lapangan Terbang Babullah
• Timika TIM - Lapangan Terbang Timika
• Yogyakarta JOG - Lapangan Terbang Antarabangsa Adisucipto [15] (Ditamatkan)
• Yogyakarta YIA - Lapangan Terbang Antarabangsa Yogyakarta [16]

Malaysia

• Kota Kinabalu BKI - Lapangan Terbang Antarabangsa Kota Kinabalu [17] (Ditamatkan)
• Kuala Lumpur KUL - Lapangan Terbang Antarabangsa Kuala Lumpur - Bandar Tumpuan Batik Air
• Pulau Pinang PEN - Lapangan Terbang Antarabangsa Bayan Lepas [18]

Singapura

• Singapura SIN - Lapangan Terbang Changi

Negara Thai

• Bangkok DMK - Lapangan Terbang Antarabangsa Don Mueang [19]

Asia Timur

Republik Rakyat China

• Guilin KWL - Lapangan Terbang Liangjiang [20][21]
• Kunming KMG - Lapangan Terbang Antarabangsa Kunming Changshui [22]
• Nanning NNG - Lapangan Terbang Wuxu [23]
• Shenzhen SZX - Lapangan Terbang Baoan [24]
• Xian XIY - Lapangan Terbang Antarabangsa Xi'an Xianyang [25]

Taiwan

• Taipei TPE - Lapangan Terbang Antarabangsa Chiang Kai Shek [26]

Oceania

Australia

• Perth PER - Lapangan Terbang Perth [27]

Perjanjian perkongsian kod

Perkongsian kod batik air dengan syarikat penerbangan berikut:

• Malindo Air